Recherche de diagnostic

En quoi consiste la recherche génétique dans le cadre d’une maladie rare ?

Les techniques de séquençage à haut débit permettent d’analyser un nombre important de données génétiques. Selon la situation clinique et l’examen prescrit, l’analyse peut notamment porter sur un panel de gènes, l’exome ou le génome.

Avant la réalisation de l’examen, une consultation de génétique pré-test permet notamment d’évaluer la situation clinique, d’expliquer les caractéristiques de l’examen proposé, ses intérêts et ses limites ainsi que les différents résultats possibles. Le consentement éclairé du patient ou de son représentant légal est recueilli avant la réalisation de l’analyse.

Trois types de résultats sont possibles

→ Un résultat contributif (anciennement dit « positif »)

Un variant pathogène est identifié et permet d’expliquer complètement ou partiellement le phénotype du patient.

Ce résultat peut notamment permettre de mieux comprendre l’origine de la maladie, d’adapter le suivi médical et paramédical, de préciser le conseil génétique et, lorsqu’elles existent, d’orienter vers des ressources ou associations adaptées.

→ Un résultat non contributif (anciennement dit « négatif »)

Aucun variant pathogène permettant d’expliquer le phénotype du patient n’a été identifié.

Ce résultat dépend des connaissances scientifiques et des limites techniques au moment de l’analyse. Il ne permet donc pas d’exclure formellement une pathologie génétique.

En fonction de la situation et de l’évolution des connaissances, une réanalyse diagnostique des données pourra être envisagée dans les années suivantes.

→ Un résultat incertain (anciennement dit « non concluant »)

Un ou plusieurs variants sont identifiés, mais leur implication dans le phénotype du patient reste incertaine en l’état actuel des connaissances.

Les connaissances scientifiques évoluant rapidement, un résultat incertain pourra éventuellement devenir contributif ou non contributif à l’avenir. Des investigations complémentaires pourront également être proposées.

Et les données incidentes ?

Lors d’un examen donnant accès au séquençage pangénomique, il est possible d’identifier fortuitement une variation génétique sans rapport avec la demande initiale : on parle de donnée incidente.

Le patient peut choisir s’il souhaite ou non être informé de ce type de résultat. Ce choix est abordé lors de la consultation et intégré au consentement.

Les données incidentes susceptibles d’être communiquées sont celles pouvant avoir un impact potentiel sur la prise en charge médicale du patient.

Après l’analyse : l’annonce des résultats

Les résultats sont expliqués lors d’une consultation de génétique post-test.

Cette consultation permet d’expliquer le résultat obtenu, ses conséquences éventuelles, les modalités de suivi et, lorsque cela est pertinent, les possibilités de poursuivre les investigations.

Après l’annonce, un compte-rendu écrit est transmis et une consultation post-annonce peut être proposée afin de revenir sur les informations délivrées, répondre aux questions et accompagner le patient et sa famille dans la suite du parcours.

Errance et impasse diagnostique

L’errance diagnostique correspond à la période allant de l’apparition des premiers symptômes à la date à laquelle un diagnostic précis est posé. Elle peut être responsable d’une aggravation de l’état de santé des patients, d’un retard dans l’accès au conseil génétique et d’une multiplication des consultations et examens diagnostiques.

L’impasse diagnostique n’est établie qu’en cas d’échec à identifier la cause précise de la maladie après avoir mis en œuvre l’ensemble des investigations disponibles en l’état actuel des connaissances.

Une situation d’impasse diagnostique n’est pas irréversible. L’évolution des connaissances scientifiques et des techniques diagnostiques, ainsi que la possibilité de procéder à une réanalyse des données, peuvent permettre d’aboutir ultérieurement à un résultat contributif. à RENVOYER SUR LA PAGE Nouveaux examens génétiques et errance diagnostic – AnDDI-Rares.

L’annonce d’un résultat contributif

Le Centre de Référence Anomalies du développement et syndromes malformatifs des Hospices Civils de Lyon a réalisé 5 fiches en FALC (Facile à Lire et à Comprendre) portant sur différents modes de transmission pouvant être expliqués lors de l’annonce d’un résultat contributif. Les fiches FALC présentées ci-dessous utilisent le terme « résultat positif », correspondant à la terminologie employée lors de leur conception et de leur certification. Chaque fiche a été déclinée avec un médecin homme et un médecin femme.