Projets de recherche

Évaluation de la pathogénicité des variants CASK de signification inconnue à travers une approche quantitative interactomique innovante

• Investigateur principal : Elodie Monsellier
• Centre/Institution : Institut de Génétique et de Biologie Moléculaire et Cellulaire (IGBMC)

Implémentation du séquençage long-read pour détecter des épimutations dans le diagnostic des maladies rares du neurodéveloppement

• Investigateur principal : Vincent MICHAUD
• Centre/Institution : Centre Hospitalier Universitaire de Bordeaux

LIRICS – (Long-read Investigation for the Resolution of Congenital Syndrome) Séquençage long-read pour résoudre les syndromes congénitaux

• Investigateur principal : Cindy Colson
• Centre/Institution : Centre Hospitalier Universitaire de Lille

Décryptage des conséquences fonctionnelles des variants SF3B1 de novoassociés aux troubles neurodéveloppementaux

• Investigateur principal : Delphine BERNARD
• Centre/Institution : Génétique, Génomique fonctionnelle et Biotechnologies (GGB) (Brest)

Ouvrir la voie à la médecine personnalisée pour les troubles neurodéveloppementaux rares

• Investigateur principal : Arnaud Monteil
• Centre/Institution : Institut de Génomique Fonctionnelle (IGF)

Développement d’un outil de diagnostic fonctionnel basé sur la cytométrie en flux pour les protéasomopathies rares

• Investigateur principal : Frederic EBSTEIN
• Centre/Institution : Institut du thorax – INSERM (Nantes)

Vers une approche rationalisée d’humanisation de la levure pour l’étude fonctionnelle de variants génétiques candidats chez des patients avec maladies rares en impasse diagnostique

• Investigateur principal : Dr Salima El Chehadeh
• Centre/Institution : Université de Strasbourg

Limb-Reg : régulation génique et malformation des membres

• Investigateur principal : Clémence VANLERBERGUE
• Centre/Institution : CHU de Lille – CRMR Anomalie des membres de Lille
• Cadre du financement : AAP réseau CEREFAM 2025
• Objectif du projet : L’objectif principal est de combiner des techniques omiques (LRS et HiC) pour détecter des altérations génomiques chez 8 patients atteints de malformations des membres en impasse diagnostique :
  • Détecter des variants structuraux (SV) complexes et des insertions d’éléments mobiles non identifiables par le séquençage à lectures courtes ;
  • Détecter les variations nucléotidiques (SNV) et de nombre
    de copies (CNV) qui ont pu être manquées par le séquençage à lectures courtes ;
  • Explorer les altérations de méthylation de l’ADN qui pourraient concerner le promoteur ou les éléments régulateurs de gènes candidats ;
  • Détecter les altérations d’interaction chromatinienne.

Profil de méthylation de l’ADN libre circulant associé au syndrome transfuseur-transfusé

• Investigateur principal : Nicolas Bourgon
• Centre/Institution : CRMR PaRaDiGM – Hôpital Necker-Enfants malades
• Cadre du financement : AAP réseau PaRaDiGM 2025
• Objectif du projet : Identifier une signature épigénétique de l’ADN libre circulant dans le sang maternel associé au syndrome Transfuseur-Transfusé au moment du diagnostic.

Analyse des mécanismes de rééquilibration du tronc dans le développement et la genèse de la scoliose idiopathique

• Investigateur principal : Antonios DINA
• Centre/Institution : Centre constitutif Spin@ de Tours
• Cadre du financement : AAP Réseau Spin@ 2025
• Objectif du projet : Évaluer l’évolution des différents paramètres barycentrométriques et stabilométriques au fil du temps en considérant l’état des cartilages neurocentraux, et les comparer entre les individus ayant une scoliose idiopathique débutante présentant une évolution favorable, une stabilité, et ceux nécessitant une intervention thérapeutique. Cette étude vise à examiner si les variations dans les paramètres barycentrométriques et stabilométriques sont associées à l’évolution des déformations rachidiennes, en relation avec les hypothèses suivantes :
  1. Le développement d’une scoliose idiopathique pourrait être un mécanisme de compensation d’un déséquilibre rachidien dans le plan sagittal, en favorisant la rotation des vertèbres pour
     atteindre un point de stabilité. Cette rotation pourrait être facilitée chez certains patients, notamment les filles, grâce à une hyperlaxité ligamentaire, contournant ainsi les raideurs
     segmentaires rachidiennes.
  2. Les contraintes biomécaniques asymétriques appliquées aux CNC pourraient induire la structuralisation des déformations rachidiennes. Ainsi, la scoliose idiopathique pourrait résulter
     de ces contraintes asymétriques sur le rachis en croissance, plutôt que d’être la cause initiale de ces contraintes

Adoption et exploitation en population de la nouvelle classification des dysraphismes

• Investigateur principal : Ferdinand DHOMBRES
• Centre/Institution : Centre coordonnateur Spin@ – Trousseau
• Cadre du financement : AAP réseau Spin@ 2025
• Objectif du projet : Mise à jour des données épidémiologiques sur les dysraphismes en France, suite à la révision de la classification ORPHANET des dysraphismes en mai 2023, en collaboration avec la Banque Nationale de Données Maladies Rares (BNDMR) :
  • Analyser l’adoption des nouveaux codes Orphanet dans les CRMR à l’échelle nationale (comparaison des périodes avant et après 2023)
  • Produire des nouvelles données de prévalence pour ces maladies avec une meilleure caractérisation des cas de dysraphismes en pré- et postnatal.
  • Evaluer la granularité du codage pour estimer des prévalences au niveau de
    groupe, disorder et sous types.

Histoire naturelle syndrome de Kabuki (HisNatKAB)

• Investigateur principal : David Geneviève
• Centre/Institution : CHU de Montpellier
• Objectif du projet : Décrire l’histoire naturelle de la maladie et identifier les clinical endpoint accessibles aux traitements potentiels.
• Statut du projet : CRF en cours de création

Description de l’histoire naturelle des patients porteurs d’un syndrome MED13L en vue d’une future thérapeutique

• Investigateur principal : Jamal GHOUMID et Roseline CAUMES
• Centre/Institution : CHU de Lille
• Objectif du projet : Description de l’histoire naturelle des patients – Identification des symptômes cibles pour
  la thérapeutique – Identification de paramètres pour déterminer l’efficacité d’éventuelles
  futures thérapeutiques
• Statut du projet : Protocole et lien avec la BNDMR réalisés. Envoi du projet au CPP à venir

Histoire naturelle des pathologies associées aux variants RNU4ATAC

• Investigateur principal : Pr Patrick EDERY
• Centre/Institution : Hospices Civiles de Lyon
• Objectif du projet : Connaitre l’histoire naturelle des pathologies associées aux variants pathogènes de RNU4ATAC et améliorer l’information donnée aux patients et le conseil génétique.
• Statut du projet : Début des inclusions prévu pour le premier trimestre 2026
• Valorisations (posters, présentations, etc) :
  • Communication orale – Lyon – 2025
  • Organisation d’une journée avec les professionnels, les associations, les patients et leurs familles

Caractérisation de l’histoire naturelle du syndrome de microduplication 7q11.23 (HINADU7)

• Coordinateurs du projet : Massimiliano ROSSI et Aurore CURIE
• Centre/Institution : Hospices Civiles de Lyon
• Objectif du projet : caractériser la trajectoire développementale des patients 7qDS concernant, notamment, les troubles de la sociabilisation.
• Statut du projet : Avis favorable du CPP reçu en Décembre 2025). CRF en cours de production. Premières inclusions prévues en Mars 2026.

Caractériser l’histoire naturelle évolutive des manifestations cliniques chez les patients porteurs d’un syndrome de Kosaki-Penttinen

• Investigateur principal : Laurence FAIVRE
• Centre/Institution : CHU de Dijon
• Objectif du projet : Caractériser l’histoire naturelle évolutive des manifestations cliniques chez les patients porteurs d’un syndrome de Kosaki ou de Penttinen, et en particulier les complications vasculaires.
• Objectifs secondaires :
  • Évaluer le rapport bénéfice/risque de l’utilisation des inhibiteurs de tyrosine kinase (ITK).
  • Évaluer la sécurité des ITK chez les patients porteurs d’un syndrome de Kosaki ou de Penttinen.
  • Évaluer l’adhésion aux recommandations standardisées de suivi et de traitement définies par le consortium.
• Statut du projet : CRF en place. Inclusions en cours.
• Valorisations :
  • Thèse de médecine 2025 : Les inhibiteurs de tyrosine kinase dans les syndromes de Kosaki et Penttinen : nouveaux patients, suivi des individus traités et revue de la littérature. Céline JOST
  • Article 2025 : Knowing and Treating Kosaki/Penttinen syndrome » international collaborative consortium: recommendations for follow-up, natural history and a real-life observational study about safety and efficacy profile of tyrosine kinase inhibitors, Yordi-Michaël BOUHATOUS, Journal of Medical Genetics

Etude de l’histoire naturelle et du fonctionnement cognitif dans le syndrome de Smith-Lemli-Opitz en France

• Investigateur principal : Pr Sylvie ODENT
• Centre/Institution : CHU de Rennes
• Objectif du projet : Décrire l’histoire naturelle du syndrome de Smith-Lemli-Opitz, la fréquence des différents traitements d’intérêt déjà prescrits et le fonctionnement cognitif des patients sur une cohorte française.
• Statut du projet : Inclusions en cours
• Valorisations :
  • Poster présenté à l’ESHG (Milan – 2025) : French guidelines for the diagnosis, follow-up and management of individuals with SLOS and establishment of a French natural history cohort – Dr Paul ROLLIER, Dr Ophélie BOUTFOL
  • Publication du PNDS en 2025

Evaluation des troubles du comportement alimentaire chez les patients porteurs d’anomalies du gène TRIP12

• Investigateur principal : Solveig HEIDE
• Centre/Institution : Assistance Publique Hôpitaux de Paris – Pitié Salpêtrière
• Objectif du projet : Evaluer la prévalence de l’obésité et des troubles du comportement alimentaire chez l’enfant et adulte avec syndrome TRIP12.
• Statut du projet : L’inclusion des patients est terminée et les analyses sont en cours.

PAOLO (PIEZO2 related distal Arthrogryposis and pathophysiOLOgy)

• Investigateur principal : Dr Klaus Dieterich
• Centre/Institution : CHU Grenoble Alpes
• Cadre du financement : AMI Recherche 2022
• Objectif du projet : Mieux déterminer le phénotype clinique, identifier des biomarqueurs thérapeutiques et des nouvelles cibles thérapeutiques
• Valorisations (posters, présentations, etc) :
  • Poster présenté aux assises de génétique à Cannes (2026) :PAOLO2 – étude de la physiopathologie des anomalies autosomiques dominantes PIEZO2 – Clara CARTAL (MSc), Cécile BETRY, Martial MALLARET, Marjolaine GAUTHIER, Frédérique NUGUES, Karine PALOMBI, John RENDU, Klaus DIETERICH